Defrosting the Digital Library: Bibliographic Tools for the Next Generation Web Many scientists now manage the bulk of their bibliographic information electronically, thereby organizing their publications and citation material from digital libraries. However, a library has been described as “thought in cold storage,” and unfortunately many digital libraries can be cold, impersonal, isolated, and inaccessible places. In this Review, we discuss the current chilly state of digital libraries for the computational biologist, including PubMed, IEEE Xplore, the ACM digital library, ISI Web of Knowledge, Scopus, Citeseer, arXiv, DBLP, and Google Scholar. We illustrate the current process of using these libraries with a typical workflow, and highlight problems with managing data and metadata using URIs. We then examine a range of new applications such as Zotero, Mendeley, Mekentosj Papers, MyNCBI, CiteULike, Connotea, and HubMed that exploit the Web to make these digital libraries more personal, sociable, integrated, and accessible places. Published: October 31, 2008
Searching for Health Preprint Server arXiv Friendly Journals Which Journals Are Okay With Preprint Servers like arXiv? Publication in Genetics/Genomics is seriously thinking of embracing what Physicists have been doing for a while, that is making their papers available online on preprint servers like arXiv before the peer-reviewed publication. In the era where social media rules, the preprint servers offer a great opportunity to increase the reach of the paper, get fast feedback, and improve the quality of the paper. This is a huge change and not all journals (or scientists) have warmed up to the idea of pre-publishing on preprint servers. Preprint Friendly Journals Top journals like Science and Nature have a clear policy on accepting non-profit preprint articles, but other specialized journals have yet to come up with a clear policy. Hope that the list grows and help the researchers to try the open-review preprint servers like arXiv before publishing in their domain of journals. Science Nature Oxford Journals [Update]
Le calendrier des 365 journées mondiales en dataviz. Plus de journées dans est disponibleen librairie Abonnez-vous pour recevoirles nouvelles dataviz Chaque jour Une fois par semaine Votre e-mail ne sera jamais communiqué à des tiers Merci de votre abonnement à 365data Un e-mail de confirmation vient de vous être envoyé Si vous ne le recevez pas Il a pu rejoindre votre dossier spam : enregistrez today@365data.frdans votre carnet d’adresses et cela ne se reproduira plus Si vous avez un compte Gmail, il a pu se loger dans l’onglet «Notifications»ou «Promotions». Votre abonnement a été mis à jour Vous pouvez offrir une journée à un(e) ami(e). Merci pour votre ami(e) ! Votre cadeau a bien été pris en compte Quelque chose nous a intrigué dans ces journées officielles qui rythment le calendrier des organisations internationales et des médias. 365data est un projet original de l'agence de dataviz WeDoData. Merci ! Vous suivez désormaisles aventures de 365 data Si vous ne recevez pas votre 1re newsletter dès demain Rendez-vousle jour du cadeau !
PrintedScholar - Your online source for posting and reviewing journal articles. Une enquête pointe le poids écrasant des fausses informations sur Facebook en matière de santé Sur les 12 derniers mois, l'algorithme de Facebook a permis aux plateformes diffusant de fausses informations sur les questions de santé d'atteindre 3,8 milliards de vues. Avec un pic en avril, au moment où la propagation du Covid-19 s'est accélérée à travers le monde. Facebook en fait-il suffisamment pour empêcher les fausses informations sanitaires de se répandre. Non, selon une enquête de l'ONG spécialisée dans le militantisme en ligne Avaaz, que France Inter a pu consulter. Les auteurs de l'étude se sont focalisés sur cinq pays : les États-Unis, le Royaume-Uni, l'Allemagne, l'Italie et la France. Pic de fausses informations en avril Ainsi, selon les enquêteurs d'Avaaz, l'algorithme de Facebook a permis aux réseaux diffusant des informations erronées à propos des questions de santé d’atteindre 3,8 milliards de vue sur les 12 derniers mois. Encore plus préoccupant : ces vecteurs de fausses informations écrasent les sources fiables, note Avaaz. Des sites et des pages publiques épinglés
Set science free from publishers' paywalls - opinion - 19 June 2012 Read full article Continue reading page |1|2 IF YOU would like to read the latest research from my lab, be my guest. Our report on a protein from a mouse version of the winter vomiting virus has just been published in the journal PLoS One and is available online for free – to anyone (vol 7, p e38723). Contrast that with my first paper, published in 1990, which you could only have read if you had access to a university library with an expensive subscription to the journal Biochemistry. Back in 1990 – before the world wide web – that was how scientific publishing was done. Many scientists are passionate supporters of open access and want to see the old model swept away. Advocates of open access claim it has major advantages over the subscription model that has been around since academic journals were invented in the 17th century. But if open access is so clearly superior, why has it not swept all before it? Unfortunately, it is prized for the wrong reasons. More From New Scientist (YouTube)
Le Japon autorise la création d'embryons humains-animaux Un scientifique japonais est devenu le premier à obtenir l’accord de son gouvernement pour la création d’embryons « hybrides », soit des embryons d’animaux contenant des cellules humaines. Jusque-là bannie par la législation du pays, la pratique controversée et considérée comme contraire à l’éthique a reçu l’approbation du ministère des Sciences nippon depuis mars dernier, rapporte Nature. Hiromitsu Nakauchi, qui dirige des équipes de chercheurs à l’université de Tokyo et à l’université Stanford en Californie, prévoit de cultiver des cellules humaines dans des embryons de souris et de rats avant de tenter l’expérience sur des porcs ou des moutons. Le but ultime de Nakauchi est de produire des animaux portant des organes constitués de cellules humaines, qui pourront être par la suite transplantés chez l’homme. Source : Nature
PeerJ Les décisions absurdes en santé Christian Morel, auteur de trois ouvrages sur les "décisions absurdes" avait sous-titré le premier tome “Sociologie des erreurs radicales et persistantes”. Cet essai publié en 2002 est devenu un best-seller maintes fois primé. La santé occupe une bonne place dans ce bêtisier de la gestion. Les décisions absurdes les plus fascinantes concernent le transport : deux pétroliers qui se croisent et se lancent dans une manoeuvre d’évitement pour finir par se percuter alors qu’il aurait suffi qu’ils gardent leur cap pour éviter la catastrophe. La santé n’est bien sûr pas épargnée : erreur de côté lors d’une opération ou de diagnostic aux urgences. Comment échapper à ces décisions absurdes ? C’est tentant, mais c’est idiot. Ces règles rigides constituent le thème du troisième tome des décisions absurdes, publié l’année dernière. Tout cela est connu de longue date, mais n’empêche pourtant pas les autorités sanitaires de fonder l’évaluation de la qualité des soins sur le respect des procédures.
Text mining: what do publishers have against this hi-tech research tool? | Science Professor Peter Murray-Rust was looking for new ways to make better drugs. Dr Heather Piwowar wanted to track how scientific papers were cited and shared by researchers around the world. Dr Casey Bergman wanted to create a way for busy doctors and scientists to quickly navigate the latest research in genetics, to help them treat patients and further their research. All of them needed access to tens of thousands of research papers at once, so they could use computers to look for unseen patterns and associations across the millions of words in the articles. It is a technique with big potential. Unfortunately, in most cases, text mining is forbidden. Any such project requires special dispensation from – and time-consuming individual negotiations with – the scores of publishers that may be involved. "That's the key fact which is halting progress in this field," said Robert Kiley, head of digital services at the Wellcome Trust. None of which would be beneficial for Elsevier's bottom line.
E-santé Le Twhit20, qu’est-ce que c’est ? Le Twhit20, ce n’est pas un outil pour mesurer l’influence. On ne saurait en aucun cas réduire l’influence à un nombre de followers. D’ailleurs, peut-on vraiment mesurer l’influence sur Twitter ? Le Twhit20, ce n’est pas non plus un outil infaillible. Mais alors, c’est quoi ? Le Twhit20, c’est comme les sondages : c’est une photographie prise à un instant T, et qui n’a d'intérêt que si elle est analysée sur le long terme. Le Twhit20, c’est aussi un outil ludique. Le Twhit20, c’est également un outil pour enrichir vos articles. Enfin, le Twhit20 c’est un outil pratique. We should aim for open refereeing of academic articles in the information age James Hartley argues that new technology used for submitting papers to academic journals increases the possibilities for gathering data, analysing it and improving the refereeing process. My recent article (Hartley, 2012) on ‘Refereeing articles in the information age’ appears to have attracted some attention. I began by summarising some of the research on peer reviewing carried out before the advent of new technology (such as Scholar One) in this respect. I then continued to list the pros and cons of this new technology – for authors, editors and publishers. I showed, with an admittedly non-representative sample of 10 editors, that editors generally found the new technology to be more advantageous the larger the enterprise. I also noted that much more information is now available to editors (and researchers) about the performances of authors, referees and editors. With new technology private comments between referees and editors can be made available for study. Through the mild: 1. 2.
Opinion: Academic Publishing Is Broken Academic publishers are currently up in arms about the Federal Research Public Access Act (FRPAA)—a bill that has the perfectly reasonable goal of making publicly funded research available to the public that funded it. Tom Allen, president of the American Association of Publishers, described it rather hysterically as “intellectual eminent domain, but without fair compensation.” Why are he and his colleagues so desperate to retain the current business model? By any objective standard, academic publishing is a very strange business indeed. It became established at a time when all publishing was on paper, when duplication and delivery were demanding problems, and when publishers provided an important service to researchers. Let's take a look at the flow of money in the production of research. At this point, researchers have worked together to produce a publication-ready, peer-reviewed manuscript. It's pretty outrageous. It’s certainly not due to cost. Michael P.